El Departamento de Química se encuentra ubicado en la ciudad de Guanajuato en dos sedes: Sede Pueblito de Rocha y Sede Noria Alta.

 UNIDAD PUEBLITO DE ROCHA

La Unidad Pueblito de Rocha: cuenta con tres edificios, dos de ellos con 9 laboratorios y 1 centro de cómputo, y el tercero con un auditorio, una biblioteca y cuatro aulas.

Los Laboratorios de Investigación que se encuentran en esta unidad son:

• Química Analítica Ambiental y de Procesos Industriales (2 laboratorios, 4 profesores), 
• Desarrollo de nuevos métodos analíticos para la determinación de diferentes compuestos/elementos de interés medio ambiental, clínico, farmacéutico e industrial (3 laboratorios, 3 profesores), 
• Electroquímica Ambiental (4 laboratorios, 4 profesores), 
• Química Organometálica y Catálisis (2 laboratorios, 5 profesores).

UNIDAD NORIA ALTA

La Unidad de Noria Alta es también la sede de la División de CNyE, y en ésta se encuentran los siguientes laboratorios de investigación:

• Sólidos Activos Naturales y Sintéticos, y Caracterización, Propiedades y Aplicaciones (3 laboratorios, 3 profesores); 
• Preparación Procesamiento y Caracterización De Materiales Catalíticos y Cerámicos (4 profesores, 3 laboratorios); 
• Síntesis Orgánica (dos laboratorios, 4 profesores), 
• Química y Tecnología del Silicio (2 laboratorios, 5 profesores), Química Teórica (dos laboratorios, 3 profesores), 
• Polímeros (1 laboratorio, 2 profesores).